با وجود گذشت بیش از دو هفته از اعلام آتش‌بس میان ایران و رژیم صهیونیستی، برخی شرکت‌های هواپیمایی مطرح منطقه‌ای و بین‌المللی همچنان پروازهای خود به ایران را متوقف کرده‌اند یا با محدودیت‌هایی همراه ساخته‌اند. طبق گزارش خبرگزاری رویترز، چهار شرکت بزرگ هواپیمایی شامل امارات، قطر ایرویز، پگاسوس و آئروفلوت از ادامه پرواز به مقصد تهران تا اطلاع ثانوی خودداری کرده‌اند.
شرکت هواپیمایی امارات تمامی پروازهای خود به تهران را تا تاریخ ۲۶ تیر ۱۴۰۴ لغو کرده و خطوط هوایی لوفت‌هانزا نیز اعلام کرده‌اند که پروازهایشان به ایران تا ۲۶ مرداد به حالت تعلیق درآمده است. همچنین هواپیمایی ترکیه‌ای پگاسوس از توقف پرواز به ایران تا پایان ماه ژوئیه (۹ مرداد) خبر داده است.
هواپیمایی قطر ایرویز، بدون تعیین زمان مشخصی، تصمیم به توقف پروازهای خود به ایران گرفته و ایرلاین روسی آئروفلوت نیز رسماً اعلام کرده که تمامی پروازهای رفت‌وآمد بین مسکو و تهران را تا زمان رفع محدودیت‌های هوایی در فرودگاه امام خمینی لغو کرده است. این محدودیت فعلاً تا اول اوت ۲۰۲۵ (۱۰ مرداد ۱۴۰۴) ادامه دارد.
همچنین گزارش‌ها حاکی از آن است که بسیاری از شرکت‌های هواپیمایی اروپایی نیز پروازهای خود به اسرائیل را تا اطلاع ثانوی متوقف کرده‌اند، از جمله ایرلاین‌هایی با مبدا فرانسه، آلمان، هلند، ایتالیا، ایرلند، لتونی و مجارستان.
در همین حال، پس از ۲۰ روز توقف فعالیت، فرودگاه بین‌المللی امام خمینی در تاریخ ۱۳ تیر با فرود نخستین پرواز شرکت فلای‌دوبی فعالیت خود را از سر گرفت، با این حال همچنان محدودیت‌هایی برای پرواز در مناطق غربی کشور اعمال شده و ساعات مجاز پرواز در این مناطق بین ۵ صبح تا ۱۸ عصر تعیین شده است.
ادامه تعلیق‌ها و محدودیت‌های پروازی نشان می‌دهد نگرانی‌های امنیتی همچنان تأثیر قابل توجهی بر روابط هوایی ایران با شرکت‌های بزرگ جهانی دارد.